Binding

基于片段的药物发现的化学位移扰动分析

Mnova Binding可以用于基于片段的药物发现的化学位移扰动分析,是一个强大的工具,可以自动处理2D HSQC实验的蛋白质配体滴定谱图,跟踪峰值移动并计算多个峰值的Kd。

对多个峰的Kd进行统计分析,还可以将测量的CSP提交给第三方软件(AFFINImeter),以便使用不同的结合模型对结合等温线进行高级分析。

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对1D和2D NMR滴定进行化学位移扰动(CSP)分析
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亮点
直观的工作流程,可让您以交互方式或全自动方式分析滴定谱图CSP
自动对峰值移动进行跟踪、测量化学位移扰动 (CSP),将其与配体浓度相匹配以计算Kd
校正拥挤谱图区域中的自动峰值移动跟踪
提供用于处理和堆叠多个2D HSQC谱图的工具,以不同的颜色显示
轻松导出CSP值,以进一步研究配体-蛋白质结合模型
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特征

自动跟踪和测量具有CSP的HSQC叠加谱图。左图显示了两个归属谱峰的移动。右侧显示了其中一个跟踪峰“13C-H”的详细信息,包括配体/蛋白质的浓度比、任意维度的CSP测量值、归一化CSP以及Kd的拟合结果和误差

化学位移扰动的常规选项卡显示了滴定波谱、蛋白质浓度、配体浓度以及配体与蛋白质浓度比的配色方案列表。

它还显示了所有分析峰的CSP测量和Kd拟合列表,以及Kd的平均值和标准误差。

只需在“titration file”中按顺序列出滴定系列即可。所用配体的名称编码在“ligands file”中。当CSP自动运行分析时,它会为“titration file”中列出的每个滴定创建不同的Mnova文件,并且Mnova文件根据配体的名称进行命名

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