基于片段的药物发现的化学位移扰动分析
Mnova Binding可以用于基于片段的药物发现的化学位移扰动分析,是一个强大的工具,可以自动处理2D HSQC实验的蛋白质配体滴定谱图,跟踪峰值移动并计算多个峰值的Kd。
对多个峰的Kd进行统计分析,还可以将测量的CSP提交给第三方软件(AFFINImeter),以便使用不同的结合模型对结合等温线进行高级分析。
自动跟踪和测量具有CSP的HSQC叠加谱图。左图显示了两个归属谱峰的移动。右侧显示了其中一个跟踪峰“13C-H”的详细信息,包括配体/蛋白质的浓度比、任意维度的CSP测量值、归一化CSP以及Kd的拟合结果和误差
化学位移扰动的常规选项卡显示了滴定波谱、蛋白质浓度、配体浓度以及配体与蛋白质浓度比的配色方案列表。
它还显示了所有分析峰的CSP测量和Kd拟合列表,以及Kd的平均值和标准误差。
只需在“titration file”中按顺序列出滴定系列即可。所用配体的名称编码在“ligands file”中。当CSP自动运行分析时,它会为“titration file”中列出的每个滴定创建不同的Mnova文件,并且Mnova文件根据配体的名称进行命名